Science子刊：開發(fā)出一種檢測新冠病毒RNA的雙色RT-LAMP檢測方法

來源：作者：人氣：-發(fā)表時間：2020-09-28 09:57:00【大中小】

新型冠狀病毒SARS-CoV-2導(dǎo)致2019年冠狀病毒?。–OVID-19），如今正在全球肆虐?；诖?，人類面臨著一項重大的公共衛(wèi)生挑戰(zhàn)?？焖贆z測現(xiàn)有的SARS-CoV-2感染和評估病毒傳播至關(guān)重要。

基于逆轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫擴增（reverse transcription loop-mediated isothermal amplification, RT-LAMP）檢測病毒RNA的方法有潛力成為簡單、可擴展和廣泛適用的檢測方法。與基于逆轉(zhuǎn)錄定量聚合酶鏈反應(yīng)（RT-qPCR）的方法相比，RT-LAMP檢測需要在恒溫下孵育，因此無需復(fù)雜的儀器設(shè)備。

在一項新的研究中，來自德國感染研究中心、德國癌癥研究中心和海德堡大學(xué)的研究人員使用了一組針對SARS-CoV-2 N基因的引物測試了用于檢測SARS-CoV-2病毒RNA的雙色RT-LAMP檢測方案。相關(guān)研究結(jié)果近期發(fā)表在Science Translational Medicine期刊上，論文標(biāo)題為“A colorimetric RT-LAMP assay and LAMP-sequencing for detecting SARS-CoV-2 RNA in clinical samples”。

這些作者從正在接受COVID-19測試的個體的768份咽拭子樣本中獲取多余的RNA樣本，并對這些樣本進行RT-LAMP檢測。他們測定了利用RT-LAMP檢測SARS-CoV-2病毒RNA的靈敏度和特異性。

與使用一組高靈敏的引物的RT-qPCR檢測方法相比，這些作者發(fā)現(xiàn)RT-LAMP檢測方法能可靠地檢測RT-qPCR測試時循環(huán)閾值（Ct）不超過30的SARS-CoV-2 RNA，靈敏度為97.5%，特異性為99.7%。

這些作者還開發(fā)了一種不需要事先進行RNA分離步驟的咽拭子直接RT-LAMP（swab–to–RT-LAMP）檢測方法，它保留了優(yōu)良的特異性（99.5%），但比RT-LAMP檢測的靈敏度低（對RT-qPCR測試時Ct<30的咽拭子樣本而言，靈敏度為86%）。此外，這些作者開發(fā)了一種多重測序方法（LAMP-sequencing, LAMP測序）作為診斷驗證程序，以檢測和記錄RT-LAMP反應(yīng)的結(jié)果。