Cell子刊解讀!科學家們深挖抗體譜尋找治療SARS-CoV-2之法!
近日,一篇刊登在國際雜志Cell Host & Microbe上題為“Mining the Antibody Repertoire for Solutions to SARS-CoV-2”的綜述文章中,來自賓夕法尼亞大學等機構的科學家們通過對來自重癥COVID-19患者機體的抗體譜進行測序揭示了在更大的多克隆應答背景下這些抗體潛在的趨同特征,研究者指出,隨著數據庫的不斷更新改進,未來科學家們或許有可能在感染或疫苗接種后利用抗體測序技術來監測病毒特異性B細胞的水平。

這項研究中,研究者Nielsen及其同事對13名經PCR確診且入院治療的COVID-19患者機體的抗體譜進行分析,該研究的一項重要優勢在于,其患者均在多個時間點進行了相關調查,同事還揭示了這些抗體譜如何在患者早期感染階段發生變化;所有患者均在一個或多個時間點檢測到了針對SARS-CoV-2刺突蛋白受體結合結構域部分(RBD)的特殊抗體,同時研究者通過患者機體的基因組DNA進行測序分析了其機體外周血單核細胞的水平,從而就能提供關于克隆圖譜的一般見解,比如多樣性和克隆突發大小等,而從RNA角度進行分析的話,研究人員還能為體細胞高頻突變分析提供抗體分型和高保真序列,其數據庫包括共來自38個樣本超過120萬個克隆,為了便于比較,研究人員利用來自此前一項研究中的114名健康成年人的對照數據庫作為對照組,此外,他們還對選定的樣本進行了單細胞策略并獲得了抗體重鏈和輕鏈讀數以用作抗體克隆和特異性分析。
定義SARS-CoV-2的免疫特性對于科學家們而言或許是一大挑戰,COVID-19存在相當大的疾病異質性,其在患者機體中所產生的抗體反應也各不相同;全球的研究人員重點集中在研究早期疾病發病上,但如果抗病毒抗體是在機體免疫反應后期獲得的話,經過幾輪選擇和抗體親和力成熟后,其或許就會變得更具有特性。大多數研究都對患者機體的血液進行了采樣,血液中充滿大量的B細胞和T細胞克隆,其中大部分與SARS-CoV-2無關,而基于組織的B細胞克隆則與機體循環中的B細胞克隆不同,其可能與疾病更加相關,除了這些困難之外,與中和SARS-CoV-2最相關的抗體在血液中非常不常見,盡管血清中的抗體非常容易檢測到,最后,在機體免疫反應中產生的看題往往是私有的,比如一個人機體中或許會產生應對病毒的免疫解決性策略,而并不是一定要產生一種能閱讀“教科書”的抗體。
當相關研究開始時,抗原特異性的SARS-CoV-2抗體序列的公共數據庫仍然相當有限,正如研究人員指出的那樣,本文研究僅代表了一個起點,同時也是一個與病毒相關序列的有用參考文庫,其之間的關系究竟如何,還有待于后期科學家們進一步研究機體應對病毒所產生的免疫反應的特性。為了加快確定SARS-CoV-2最相關的免疫組庫特性,研究人員之間就需要共享數據,而研究者Nielsen及其同事的做法堪稱典范,他們共享了數據并將不同的數據進行了對比,目前研究人員正在通過聯合研究來開發抗原特異性的B細胞和T細胞基序數據庫。隨著更多數據能夠通過公共數據庫來獲得,不同的研究成果也將會被整合從而提供關于抗原特異性和疾病相關克隆表型的參考文庫,相信通過后期科學家們不斷深入的研究,他們將會對機體應對SARS-CoV-2所產生的免疫反應有一個更加全面的理解。
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