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重磅!鑒定出導(dǎo)致血癌前疾病的遺傳性變異和獲得性突變

來源:作者:人氣:-發(fā)表時(shí)間:2018-07-17 16:00:00【
克隆性造血(clonal hematopoiesis)是一種與年齡相關(guān)的白細(xì)胞病癥。它與較高的某些血癌和心血管疾病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)聯(lián)。在一項(xiàng)新的研究中,來自美國哈佛醫(yī)學(xué)院和哈佛陳曾熙公共衛(wèi)生學(xué)院等研究機(jī)構(gòu)的研究人員鑒定出首批已知的遺傳性基因變異中的一些基因變異能夠顯著增加一個(gè)人患上克隆性造血的幾率。相關(guān)研究結(jié)果于2018年7月11日在線發(fā)表在Nature期刊上,論文標(biāo)題為“Insights into clonal haematopoiesis from 8,342 mosaic chromosomal alterations”。論文通信作者為哈佛醫(yī)學(xué)院的Po-Ru Loh、Giulio Genovese、Steven A. McCarroll和哈佛陳曾熙公共衛(wèi)生學(xué)院的Alkes L. Price。
 
圖片來自CC0 Public Domain。
在過去10年的一系列研究中,人們已發(fā)現(xiàn)這種病癥的特征是遺傳異常的白細(xì)胞堆積,這些白細(xì)胞可能變成癌細(xì)胞或?qū)е聞?dòng)脈粥樣硬化斑塊中的炎癥,這是心臟病發(fā)作和中風(fēng)的一種強(qiáng)效的風(fēng)險(xiǎn)因素。
McCarrol說,“克隆性造血越來越被認(rèn)為是未來疾病風(fēng)險(xiǎn)的一種重要的生物標(biāo)志物,但是我們并不知道它是由什么導(dǎo)致的。”他說,“這些發(fā)現(xiàn)揭示出遺傳事件---一些遺傳事件是遺傳性的,其他的遺傳事件是獲得性的---發(fā)生的特定順序?qū)е逻@些異常的血細(xì)胞產(chǎn)生。”
這項(xiàng)研究還得出了令人吃驚的結(jié)論:遺傳性基因變異和獲得性突變之間要比之前所理解的存在著更多的關(guān)聯(lián)性。人們一般認(rèn)為獲得性突變會(huì)隨著時(shí)間的推移隨機(jī)地發(fā)生,而且是自發(fā)性出現(xiàn)的或者是在接觸紫外線等有害物質(zhì)后出現(xiàn)的。但是,這些研究人員發(fā)現(xiàn)了一些例子,在這些例子中,遺傳性基因變異導(dǎo)致在生命后期出現(xiàn)特定的獲得性突變,或者讓攜帶著獲得性突變的細(xì)胞比其他細(xì)胞具有生長(zhǎng)優(yōu)勢(shì)。
McCarroll 說,“從概念上講,這項(xiàng)研究中最有趣的事情之一就是模糊了遺傳性基因變異和獲得性突變之間的區(qū)別。遺傳的等位基因經(jīng)證實(shí)對(duì)之前被認(rèn)為是一個(gè)更加隨機(jī)的過程產(chǎn)生了強(qiáng)大的影響。”
不成比例
在正常情形下,在人體的1萬至2萬個(gè)造血干細(xì)胞中,每個(gè)造血干細(xì)胞都會(huì)為身體的全部細(xì)胞提供大致相同數(shù)量的成熟血細(xì)胞。結(jié)果就是產(chǎn)生數(shù)千億個(gè)血細(xì)胞。
當(dāng)單個(gè)造血干細(xì)胞獲得導(dǎo)致它產(chǎn)生更多的血細(xì)胞(包括白細(xì)胞)的突變時(shí),克隆性造血就會(huì)發(fā)生。幾年后,這些發(fā)生突變的血細(xì)胞因增殖得更快或者存活更長(zhǎng)的時(shí)間而在與正常的血細(xì)胞的競(jìng)爭(zhēng)中勝出。單個(gè)發(fā)生突變的造血干細(xì)胞產(chǎn)生的后代細(xì)胞可能占人體內(nèi)白細(xì)胞總數(shù)的2%,或20%,或90%以上,而不是正常時(shí)的0.0001%。這些遺傳上占優(yōu)勢(shì)的血細(xì)胞被稱為亞細(xì)胞克隆(subclone)。
來自McCarroll實(shí)驗(yàn)室和其他人的之前研究已表明僅一些亞細(xì)胞克隆會(huì)造成麻煩。比如,僅大約10%的克隆性造血患者在之后會(huì)患上血癌。即便如此,這種風(fēng)險(xiǎn)也要比美國總?cè)丝诟叱?0倍。
在這項(xiàng)新的研究中,McCarroll團(tuán)隊(duì)著手了解基因組中的哪些部分在亞細(xì)胞克隆中發(fā)生突變,哪些突變是最有害的,以及這些亞細(xì)胞克隆是如何產(chǎn)生和擴(kuò)大其數(shù)量的。
為此,Loh和Genovese開發(fā)了一種數(shù)學(xué)方法,從而允許他們?cè)谠缙?--當(dāng)亞細(xì)胞克隆占人血細(xì)胞的比例低至1%時(shí)----識(shí)別出這些亞細(xì)胞克隆。之前的檢測(cè)亞細(xì)胞克隆的方法是不精確的,除非它們占人體白細(xì)胞的比例已增加到至少15%~20%。
憑借他們的新技術(shù),Loh和Genovese分析了15.1萬名向英國生物銀行(UK Biobank)捐贈(zèng) 了樣品的人的血液中的DNA。
畢竟不是那么隨機(jī)的
這種敏感度的提高使得這些研究人員能夠在8000多名參與者中找到這樣的亞細(xì)胞克隆,其中很多參與者已獲得類似的突變。令這些研究人員吃驚的是,攜帶著類似的獲得性突變的參與者通常在這些獲得性突變的附近發(fā)生罕見的遺傳性基因變異。進(jìn)一步的研究證實(shí)這絕非巧合;這些遺傳性基因變異對(duì)人們是否在以后的生活中獲得其他的突變產(chǎn)生強(qiáng)大的影響。
Loh說,“當(dāng)Giulio提出探究遺傳性基因變異的影響時(shí),我從沒想過會(huì)發(fā)現(xiàn)任何引人關(guān)注的東西。當(dāng)我第一次看到這些研究結(jié)果時(shí),存在的關(guān)聯(lián)性是如此強(qiáng)烈以至于我想知道是否是代碼中存在錯(cuò)誤。”
這些研究人員隨后能夠找出遺傳性基因變異讓人們易于產(chǎn)生亞細(xì)胞克隆的特定方式。遺傳性基因變異和獲得性突變通常出現(xiàn)在基因組的相同部分上。一些遺傳性基因變異讓染色體上的某些位點(diǎn)更容易在未來發(fā)生突變。其他的遺傳性基因變異為未來的突變創(chuàng)造了簡(jiǎn)便的方法,以便增加細(xì)胞增殖速率。在某些情況下,一種遺傳性基因變異讓一個(gè)通常抵抗癌癥的基因的一個(gè)拷貝失活。后來,獲得性突變讓另一個(gè)拷貝失活。
McCarroll說,“這些都是癌癥遺傳學(xué)家所說的兩次打擊模型(two-hit model)的例子,在這種模型中,遺傳性等位基因是第一次打擊,隨后的獲得性突變是第二次打擊。這仍然不會(huì)導(dǎo)致癌癥,但是很多擁有這樣的突變組合的白細(xì)胞幾乎肯定會(huì)讓人處于更加不利的地步。”
另一種遺傳性基因變異讓一個(gè)促進(jìn)細(xì)胞生長(zhǎng)的基因的一個(gè)拷貝失活。這起初讓這些研究人員感到困惑,這是因?yàn)檫@種遺傳性基因變異似乎阻止侵襲性細(xì)胞生長(zhǎng)或癌癥產(chǎn)生。但是許多遺傳了這種基因變異的人后來會(huì)獲得了一個(gè)突變,這個(gè)獲得性突變會(huì)利用來自另一個(gè)親本的全功能性基因拷貝替換這個(gè)失活的基因拷貝。具有這個(gè)獲得性突變的細(xì)胞在與其他細(xì)胞的競(jìng)爭(zhēng)中勝出。
這些研究人員發(fā)現(xiàn)的這些遺傳性基因變異是罕見的,而且遺傳一種基因變異并不能保證一個(gè)人會(huì)患上克隆性造血。然而,某些遺傳性基因變異確實(shí)更有可能獲得具有特定突變的亞細(xì)胞克隆---相比正常的低于1%的風(fēng)險(xiǎn),這些遺傳性基因變異導(dǎo)致的風(fēng)險(xiǎn)高達(dá)50%。
這些研究人員甚至發(fā)現(xiàn)了這樣的例子:遺傳相同基因變異的多個(gè)家庭成員接著會(huì)產(chǎn)生具有相同突變的亞細(xì)胞克隆。他們認(rèn)為他們的發(fā)現(xiàn)很可能并非偶然。
McCarroll說,“我認(rèn)為可以安全地預(yù)測(cè)這些是一個(gè)我們將會(huì)一次又一次觀察的現(xiàn)象的早期例子。”
亞細(xì)胞克隆統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)
一些獲得性突變?cè)谂灾懈R姡渌墨@得性突變?cè)谀行灾懈R姟1M管一般來說,亞細(xì)胞克隆在老年人中更為常見,但是兩個(gè)獲得性突變?cè)谒心挲g段都會(huì)出現(xiàn),這提示著它們是在發(fā)育期間產(chǎn)生的,而并非來自年齡相關(guān)的過程。這些發(fā)現(xiàn)促進(jìn)進(jìn)一步開展研究來理解每個(gè)獲得性突變的性質(zhì)和后果。
McCarroll說,“盡管可以說,平均而言,亞細(xì)胞克隆可能會(huì)使得患上血癌的風(fēng)險(xiǎn)增加十倍,但是這并不意味著每個(gè)特定的亞細(xì)胞克隆都會(huì)如此。一個(gè)關(guān)鍵的方向是從總體上談?wù)搧喖?xì)胞克隆到根據(jù)每個(gè)亞細(xì)胞獲得的特定突變和在血液中的數(shù)量,了解每個(gè)亞細(xì)胞克隆的歷史和風(fēng)險(xiǎn)狀況。”
McCarroll說,隨著相關(guān)信息不斷積累,人們將能夠更好地評(píng)估每個(gè)亞細(xì)胞克隆的風(fēng)險(xiǎn),并嘗試開發(fā)環(huán)境或醫(yī)學(xué)干預(yù)措施來減緩亞細(xì)胞克隆的生長(zhǎng)和避免疾病產(chǎn)生。
參考資料:
Po-Ru Loh, Giulio Genovese, Robert E. Handsaker et al. Insights into clonal haematopoiesis from 8,342 mosaic chromosomal alterations. Nature, Published online: 11 July 2018, doi:10.1038/s41586-018-0321-x.
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