Nature解決難題：超靈敏游離 RNA（cfRNA）檢測方法
摘要：研究人員開展了 RARE-seq方法的優化研究。
敏感的游離 RNA（cfRNA）檢測方法有助于進行非侵入性基因表達分析和疾病監測。
這里介紹了 RARE-seq（隨機引物和 cfRNA 片段親和捕獲測序富集分析），這是一種針對 cfRNA 分析優化的方法。研究表明血小板污染會嚴重干擾 cfRNA 分析，并開發出克服該問題的方法。在分析驗證中，發現 RARE-seq 檢測腫瘤來源的 cfRNA 的靈敏度比全轉錄組 RNA 測序（RNA-seq）高約 50 倍，檢測限為 0.05%。
圖1 一種超靈敏的無細胞RNA檢測方法為探究臨床實用性，研究人員對 369 名癌癥患者、非惡性疾病患者和對照組的 437 份血漿樣本進行分析。結果顯示，在 cfRNA 中檢測非小細胞肺癌表達特征的靈敏度隨疾病分期增加（I 期 20 例中有 6 例（30%）；II 期 8 例中有 5 例（63%）；III 期 15 例中有 10 例（67%）；IV 期 96 例中有 80 例（靈敏度 83%，特異性 95%）），且 RARE-seq 比基于腫瘤未知的循環腫瘤 DNA（ctDNA）分析更靈敏。在對酪氨酸激酶抑制劑產生耐藥性的 EGFR 突變非小細胞肺癌患者中，檢測到了組織學轉化和基于突變的耐藥機制。
圖2 血液采集和cfRNA提取的優化
最后，研究還證明了 RARE-seq 在確定腫瘤起源組織、評估良性肺部疾病和追蹤 mRNA 疫苗反應方面的潛在用途。這些結果突出了超靈敏 cfRNA 分析的潛在價值，并為多種臨床應用提供了概念驗證。
參考資料
[1] An ultrasensitive method for detection of cell-free RNA
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