Science子刊：發現經常突變的癌蛋白的空間染色體組織的新作用
威斯達研究所的一項新研究揭示了蛋白質ARID1A的功能，該蛋白由一種基因編碼，這種基因是人類癌癥中最常見的突變之一。根據發表在《Science Advances》上的這項研究，ARID1A在基因組的空間組織中發揮著作用；因此，它的缺失對整體的基因表達具有廣泛的影響。這一發現為破譯與幾種癌癥特別是卵巢癌相關的分子變化提供了重要信息。
"我的實驗室一直在研究ARID1A作為SWI/SNF復合物的一部分在基因表達調控中的作用，"Wistar研究所癌癥中心副主任、首席研究員、基因表達調控項目的教授兼聯合項目負責人Rugang Zhang博士說。"在我們尋找這種復合物的新相互作用蛋白的過程中，我們發現了一種新的蛋白質，它為ARID1A作為空間染色體組織的全基因組調節劑的功能提供了新的視角。"
基因組的三維結構決定了DNA分子如何在一個微觀空間中堆積，同時也允許每個基因在適當的時間進行轉錄和表達。研究小組發現，ARID1A與凝素II復合物的一個組分相互作用，后者通過組織染色體結構來調控基因表達。
Zhang補充說："這是一個精細調控的過程，我們發現ARID1A在其中發揮著關鍵作用。"
結果表明ARID1A決定了凝血酶II在某些稱為增強子的DNA調控元件上的基因組定位。因此，當ARID1A功能因基因突變而喪失時，凝縮素II的分布發生改變，大量基因的表達也隨之改變。
Zhang和他的同事還發現，通過與凝縮素II的相互作用，ARID1A控制著染色體的不同部分如何在空間上組織在一起，這些區域被稱為染色體區域，有助于某些基因的協調表達。
"我們的發現為癌癥中的染色質調控領域增加了一個重要的部分，"該研究的第一作者之一、Zhang博士實驗室的博士后研究員Shuai Wu博士說。"通過改變染色體的特殊結構，ARID1A基因的缺失對基因表達的影響將比我們最初認為的要廣泛得多。"
參考資料：
Shuai Wu et al.ARID1A spatially partitions interphase chromosomes" Science Advances (2019). DOI： 10.1126/sciadv.aaw5294
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