《PNAS》AlphaFold2助力揭示細胞質(zhì)量控制的關(guān)鍵蛋白復(fù)合物
摘要：任何一個試圖把床單整理整齊的人都會告訴你:折疊是很難的。
任何一個試圖把床單整理整齊的人都會告訴你:折疊是很難的。如果你洗衣服的方式不對，結(jié)果可能是一堆皺巴巴的、皺巴巴的織物，但是當(dāng)大約7000種具有折紙般的復(fù)雜性、調(diào)節(jié)基本細胞功能的蛋白質(zhì)折疊失敗時，結(jié)果可能導(dǎo)致從肺氣腫、囊性纖維化到阿爾茨海默病等多種嚴重疾病中的一種。幸運的是，我們的身體有一個質(zhì)量控制系統(tǒng)，可以識別錯誤折疊的蛋白質(zhì)，并將它們標記為額外的折疊工作或破壞，但是，這個質(zhì)量控制過程究竟是如何起作用的，我們還不完全清楚。馬薩諸塞大學(xué)阿姆赫斯特分校(University of Massachusetts Amherst)的研究人員發(fā)現(xiàn)了所有行為發(fā)生的“熱點”，在我們對這種質(zhì)量控制系統(tǒng)如何工作的理解上取得了重大飛躍。這項研究最近發(fā)表在《PNAS》上。
DNA可能是生命的主要藍圖，但它是由蛋白質(zhì)組成的。雖然它們中的許多結(jié)構(gòu)簡單，但在細胞的分泌途徑中必須產(chǎn)生大約7000種蛋白質(zhì)，這些蛋白質(zhì)要么分散在整個細胞中，要么分泌到細胞外空間，以執(zhí)行它們的基本功能。
圖1 深入了解ER折疊的看門人UGGT與其伴侶硒蛋白SEP15之間的相互作用
這個故事始于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)——負責(zé)正確構(gòu)建數(shù)千種不同蛋白質(zhì)的細胞蛋白質(zhì)工廠——并涉及兩個主要參與者:一種被稱為UGGT的酶和伙伴蛋白Sep15。
資深作者Daniel Hebert(麻省大學(xué)阿姆赫斯特分校生物化學(xué)和分子生物學(xué)教授)和Lila Gierasch(麻省大學(xué)阿姆赫斯特分校生物化學(xué)和分子生物學(xué)和化學(xué)杰出教授)以及合著者Kevin Guay(麻省大學(xué)阿姆赫斯特分校分子細胞生物學(xué)項目的研究生)在之前的研究中表明，UGGT通過讀取碳水化合物標簽(稱為N-聚糖)起到了“看門人”的作用。嵌入到蛋白質(zhì)中以確定蛋白質(zhì)是否正確折疊。
“但還有別的東西在起作用，”主要作者Rob Williams說，他是Hebert和Gierasch實驗室的博士后研究員。“有一種獨特的蛋白質(zhì)叫做‘硒蛋白’，它含有稀有元素硒。在我們體內(nèi)大約20,000種不同的蛋白質(zhì)中，只有25種是硒蛋白。UGGT的伙伴Sep15是一種硒蛋白。Sep15總是與UGGT聯(lián)系在一起。但直到現(xiàn)在，沒有人知道它在那里做什么。”
Williams和他的合著者利用一種名為AlphaFold2的人工智能模型預(yù)測，Sep15蛋白形成了一個復(fù)雜的螺旋形狀，看起來有點像接球手的手套，而這個手套與UGGT酶上的互補位點完美匹配。SEP15和UGGT結(jié)合的特定位點也是UGGT讀取N-聚糖編碼的地方，該編碼告訴它蛋白質(zhì)是否正確折疊。
“基本上，”Hebert說，“我們已經(jīng)找到了所有活動發(fā)生的熱點，Sep15是關(guān)鍵。”
圖2 ER中的專門質(zhì)量控制系統(tǒng)監(jiān)督糖蛋白成熟
為了驗證他們的AlphaFold2生成的預(yù)測，研究小組設(shè)計了一個實驗，使用重組DNA重組UGGT來中斷其與Sep15的結(jié)合，并且，修飾后的UGGT確實未能與Sep15形成復(fù)合物。
那么，Sep15到底在做什么呢?“有兩種可能性，我們都在跟進，”Hebert說。“要么是Sep15給了錯誤折疊的蛋白質(zhì)一個糾正其形狀的機會，要么是標記了該蛋白質(zhì)的破壞。”
“我們正在研究的蛋白質(zhì)的復(fù)雜性允許更高形式的生命發(fā)揮作用，”Gierasch說，“但這些蛋白質(zhì)的復(fù)雜性也意味著它們更容易發(fā)生錯誤折疊錯誤，如果質(zhì)量控制過程失敗，錯誤折疊錯誤可能會造成災(zāi)難性的后果。”
盡管仍有大量的基礎(chǔ)研究要做，但該團隊的研究為針對Sep15/UGGT界面的新型藥物治療奠定了基礎(chǔ)。“這是一個尚未開發(fā)的制藥領(lǐng)域，”Hebert說，“Williams的研究將我們推向了最終治療的正確方向。”
這項研究得到了美國國家普通醫(yī)學(xué)科學(xué)研究所的支持，并得到了馬薩諸塞大學(xué)阿默斯特應(yīng)用生命科學(xué)研究所儀器的支持。
參考資料
[1] Insights into the interaction between UGGT, the gatekeeper of folding in the ER, and its partner, the selenoprotein SEP15
 |
 |
 |
| 官網(wǎng)：www.baichuan365.com | 微信服務(wù)號：iseebio | 微博：seebiobiotech |
 |
 |
 |
| 商城：mall.seebio.cn | 微信訂閱號：seebiotech | 泉養(yǎng)堂：www.canmedo.com |
相關(guān)資訊
- Poly-L-Ornithine 溶液
- 西寶生物邀您共賞 杭州美容美發(fā)美體化妝品博覽會
- 分子診斷是IVD市場的新力軍，即時診斷是IVD發(fā)展大勢
- Galα-3Gal oligosaccharides 半乳糖α-3半乳低聚糖 - Elicityl細菌發(fā)酵生產(chǎn)低聚葡聚糖產(chǎn)品 (4)
- 脂蛋白相關(guān)磷脂酶A2（Lp-PLA2）檢測原理及相關(guān)原料
- 單抗助力【GLP-1】及【Exendin-4】新功能探索
- 年輕人，當(dāng)心了！新研究揭示：現(xiàn)在不關(guān)心血壓，未來或比同齡人“更傻”
- Nature：靶向潘氏細胞產(chǎn)生的Notum可讓衰老的腸道干細胞恢復(fù)青春
- 單細胞RNA性能分析新方法
- Nature重磅：預(yù)先抑制TNF顯著增強PD-1和CTLA-4聯(lián)合免疫療法療效并降低副作用
新進產(chǎn)品
同類文章排行
- 《PNAS》AlphaFold2助力揭示細胞質(zhì)量控制的關(guān)鍵蛋白復(fù)合物
- 《Nature Neuroscience》阿爾茨海默病不僅僅是神經(jīng)元
- Science突破性研究揭示了TIP60在DNA通路和疾病機制中的作用
- Science子刊：新治療方法促進小鼠多能干細胞的產(chǎn)生
- Nature：SARS-CoV-2一部分蛋白質(zhì)與人類蛋白質(zhì)SNX8非常相似
- Nature：免疫系統(tǒng)在對抗癌癥的過程中最大的敵人居然是自己！
- Cell子刊：獨特的機制保護胰腺細胞免受炎癥的影響
- 《Current Biology》廣為人知的噬菌體感染又有新發(fā)現(xiàn)
- 《Nature》新發(fā)現(xiàn)揭示了DNA修復(fù)途徑的關(guān)鍵過程
- 《Science》發(fā)現(xiàn)乳腺癌與大腦的“高速通路”——神經(jīng)元
資訊文章
您的瀏覽歷史
