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Spike蛋白 (S蛋白) — 新型冠狀病毒COVID-19研究關鍵性靶標

來源:作者:人氣:-發表時間:2020-03-18 15:53:00【
如果把人類的細胞比作是一座防御堅固的城池,那么Spike蛋白(S蛋白)就是新型冠狀病毒(COVID-19)入侵這座城池的“攻城錘”。S蛋白是2019新冠病毒COVID-19附著并感染人類細胞的關鍵性靶標,是病毒入侵人類細胞的特洛伊木馬。
冠狀病毒知多少?
冠狀病毒(Coronaviruses,CoV)屬于尼多病毒目冠狀病毒科,為有包膜的單股、正鏈RNA病毒,分為α,β和γ三個屬。冠狀病毒粒子呈球形或不規則形,有囊膜,大小為80-120 nm。其基因組的5’端帶有帽子結構,其后包含6-10個開放閱讀框(Open reading frames,ORFs)。占據基因組2/3的閱讀框編碼復制酶,基因組的另1/3主要編碼結構蛋白,一般包括棘突蛋白(spike,S)、小包膜蛋白(envelope,E)、囊膜蛋白(membrance,M)、核蛋白(nucleocapsid,N)。E蛋白和M蛋白主要參與病毒的裝配過程,N蛋白包裹基因組形成核蛋白復合體.
2019新型冠狀病毒(COVID-19)解讀
2019新型冠狀病毒(COVID-19)是一類呈球形、表面有突起、電鏡下觀察形似皇冠的病毒,病毒基因為連續線性單鏈RNA,直徑在75-160nm。SARS-CoV-2是目前發現的可以感染人類的冠狀病毒科中的第七個成員。其他6個成員分別為:HCoV 229E、HCoV NL63、HCoV OC43、HCoV HKU1、SARS-CoV和MERS-CoV。COVID-19與SARS-CoV和MERS-CoV同屬于β冠狀病毒。
SARS-CoV-2病毒的電鏡照片
中國疾病預防控制中心公布的SARS-CoV-2病毒的電鏡照片

中國疾病預防控制中心公布的SARS-CoV-2病毒的電鏡照片
在病毒入侵人體時,Spike蛋白發揮的作用
棘突糖蛋白(S蛋白)是一類很大的三聚體跨膜糖蛋白,有著大量糖基化的修飾,其在病毒表面形成特殊的花冠結構。它首先結合細胞表面的受體,然后發生“變形”,順勢將病毒包膜與細胞膜融為一體,從而將病毒內的遺傳物質注入細胞,達到感染細胞的目的。
Spike 蛋白是冠狀病毒重要的表面膜蛋白,含有兩個亞基S1和S2。其中S1主要包含有受體結合區(RBD),負責識別細胞的受體。S2含有膜融合過程所需的基本元件。Spike 蛋白承擔病毒與宿主細胞膜受體結合及膜融合功能,是宿主中和抗體的重要作用位點以及疫苗設計的關鍵靶點。
中國科學院微生物研究所在國家微生物科學數據中心與社會廣大科技工作者共享了2019新型冠狀病毒蛋白(S蛋白)受體結合區域(RBD)和人受體ACE2復合物2.5埃分辨率晶體結構,揭示S蛋白如何與受體ACE2在原子層面相互作用。

資料來源于微生物國家科學數據中心,編號:NMDCS0000001
2月19日,德克薩斯大學奧斯汀分校和美國國立衛生研究院的研究小組發表在《科學》雜志上的一項新研究指出,他們創建了新冠病毒附著并感染人類細胞部分的3D原子尺度結構圖,這是研究疫苗和治的方法關鍵一步。
SARS-CoV-2關鍵部位S蛋白3D影像圖
注:圖A為已經公開的新冠病毒序列;圖B為不同角度新冠病毒S蛋白圖像,RBD“向上”原聚體以帶狀顯示,顏色與圖A相對應(綠色)。
2019新型冠狀病毒就是表面S蛋白通過識別人類宿主的ACE2蛋白從而進入細胞,S蛋白結構域的細胞受體結合區(Receptor binding domain,RBD)直接參與了宿主受體的識別,該區域的氨基酸變異會導致病毒的種屬嗜性和感染特性的變化。2019新型冠狀病毒(COVID-19)S蛋白決定了病毒的傳播能力、傳播范圍,是抗病毒藥物、疫苗設計、診斷方法開發的關鍵靶標,發揮著無可替代的作用。
Spike蛋白(S蛋白)& N蛋白 系列產品
西寶生物現推出Spike蛋白(S蛋白)& N蛋白系列產品,純度、生物活性、穩定性均經過嚴格驗證。訂購熱線:400-021-8158
S蛋白產品列表
貨號
品名
描述
包裝規格
19nSeebio-001
2019-nCoV Spike Protein (RBD, Fc Tag)
真核表達
1mg
19nSeebio-002
2019-nCoV Spike Protein S1 (His Tag)
真核表達
1mg
19nSeebio-003
2019-nCoV Spike Protein S1 (Fc Tag)
真核表達
1mg
19nSeebio-009
2019-nCoV Spike Protein N (His Tag)
大腸桿菌表達
1mg
西寶生物密切關注著疫情的發展態勢,不斷整合優化著病毒蛋白類產品、相關抗體及檢測試劑原料產品線,以助力抗新冠病毒治病藥物、檢測試劑盒、疫苗的開發。
蛋白/重組蛋白
貨號
品名
描述
包裝規格
19nRD933-ZN
Recombinant Human ACE-2 Protein, CF
NS0表達體系
10ug
19nRD3437-ZN
Recombinant Mouse ACE-2 Protein, CF
CHO表達體系
10ug
19nRD4516-ZN
Recombinant Rat ACE-2 Protein, CF
NS0表達體系
10ug
19nSeebio-001
2019-nCoV Spike Protein (RBD, Fc Tag)
真核表達
1mg
19nSeebio-002
2019-nCoV Spike Protein S1 (His Tag)
真核表達
1mg
19nSeebio-003
2019-nCoV Spike Protein S1 (Fc Tag)
真核表達
1mg
19nSeebio-009
重組2019-nCoV N蛋白(His Tag)
大腸桿菌表達系統
100ug
500ug
1mg
19nSeebio-005
ACE-2 Protein, Human,Recombinant,(Fc Tag)
1
1mg
19nSeebio-006
ACE-2 Protein, Human,Recombinant,(His Tag)
1
1mg
19nSeebio-007
(Miragen:268450)
重組Cas13a蛋白
用于RNA剪切
100pmol
19nSeebio-010
(Miragen:268475)
重組Cas13a蛋白
用于RNA剪切
500pmol
19NGA-P002
2019-nCoV E蛋白,包膜蛋白
2019-nCoV抗原蛋白,大腸桿菌表達
1mg

抗體
貨號
品名
描述
包裝規格
016-030-084
辣根過氧化物酶標記鏈霉親和素
 
1ml
109-035-098
辣根過氧化物酶標記親和純化山羊抗人IgG二抗,與Fcγ片段特異性反應(經牛,馬,小鼠血清蛋白吸附)
 
1ml
115-035-164
過氧化物酶山羊抗小鼠IgG,(subclasses 1+2a+2b+3), Fcγ Fragment Specific (min X Hu,Bov,Rb Sr Prot)
 
1ml
109-035-129
山羊抗人IgM過氧化物酶,Fc5μ Fragment Specific (min X Bov Sr Prot)
 
1.5ml
DCY4500A
Monoclonal Mouse Anti-Human IgM antibody
 
1mg
DCY4501A
Monoclonal Mouse Anti-Human IgG antibody
 
1mg
EKY0465A
SARS-CoV-2 (2019-nCoV) Nucleocapsid antibody, Rabbit MAb
 
50ul
EKY0466A
SARS-CoV-2 (2019-nCoV) Spike antibody, Rabbit MAb
 
50ul
EKY0477A
SARS-CoV-2 (2019-nCoV) S1 antibody, Rabbit MAb
 
50ul
19nRDAF933
Human ACE-2 Antibody
IHC, IP, Simple Western, WB
100ug
19nRDAF3437
Mouse ACE-2 Antibody
IHC, IP, Simple Western, WB
100ug
19nRDMAB933
Human ACE-2 Antibody
IHC, WB
500ug
19nRDBAF933
Human ACE-2 Biotinylated Antibody
IHC, WB
50ug
19nRDMAB9331
Human ACE-2 Antibody
IP, WB
100ug
19nRDMAB3437
Mouse ACE-2 Antibody
WB
100ug

小分子化合物
貨號
品名
描述
包裝規格
19nRD2578
Benazepril hydrochloride
ACE 抑制劑
50mg
19nRD4302
Perindopril erbumine
ACE 抑制劑
50mg
19nRD4455
Captopril
ACE 抑制劑,也抑制 LTA4 水解酶
50mg

檢測試劑
貨號
品名
描述
包裝規格
19nRDES007
Mca-YVADAPK(Dnp)-OH Fluorogenic Peptide Substrate
ACE-2 和 Caspase-1 的底物
1mg
19NGAE094-LP
Probe One-Step Qrt-PCR Kit
一步法RT-qPCR(探針法)
100次
MDX032
Fast 1-Step RT-qPCR Mix
 
10 mL
100ml
MDX024
Lyo-Ready 1-Step RT-qPCR Mix
 
10 mL
100ml
MDX062
Lyo-Ready 1-Step RT-qPCR Virus Mix
 
10 mL
100ml

貨號
品名
描述
包裝規格
19NGAE126
Reverse Transcriptase
反轉錄酶
10000U
19NGAE047
SuperMix(gDNA Purge)
反轉錄酶
50次
19NGAE098
Tth DNA Polymerase
TTH酶
250U
19NGAE108
HotStart Tth DNA Polymerase(熱啟動TTH)
TTH酶
250U
19NGAE125
RNase Inhibitor
核糖核酸酶抑制劑
3000U
AM2694
SUPERase•In™ RNase Inhibitor
 
10,000 units
19nSeebio-007
Taq DNA聚合酶
 
1KU
19NGAE017
HotStart Taq DNA Polymerase(化學修飾法)
熱啟動Taq酶
250U
19NGAE097
HotStart Taq DNA Polymerase(B)(抗體修飾法)
熱啟動Taq酶
250U
19NGAE014
Bst DNA Polymerase
等溫擴增酶
250U
19NGAE015
Bst DNA Polymerase
等溫擴增酶
800U
19NGAE012
Phi29 DNA Polymerase
等溫擴增酶
125U
19NGAE013
Phi29 DNA Polymerase
等溫擴增酶
125U
19NGAE063
Heat-labile Uracil-DNA Glycosylase(熱敏型)
防污染UDG酶
 100U
19NGAE060
Uracil-DNA Glycosylase
防污染UDG酶
200U
19NGAM062-YH01
Vaccinia Capping System
加帽酶(RNA加帽)(疫苗開發)
500U
19NGAE121
T7 RNA Polymerase
T7 RNA 聚合酶(疫苗開發)
5000U

樣品釋放劑
貨號
品名
描述
包裝規格
DGZ0290C
表面活性素(Surfactin)
于核酸釋放劑,可以破壞病毒的細胞膜,快速釋放出完整的核酸分子,使病毒DNA/RNA充分析出
10mg

表達基因
貨號
品名
描述
包裝規格
19nSeebio-008
編碼新型冠狀病毒受體(hACE2)基因的表達載體
用于hACE2受體合成
10ug

其他PCR相關
貨號
品名
包裝規格
ECI0206B
dUTP, 100mM Solution 脫氧尿苷三磷酸溶液(100 mM)
1ml
DCI0067B
dNTP Mix (25 mM each)
1ml

熒光染料、引物和探針
貨號
品名
描述
包裝規格
EAA0065A
S-RPA-Forward_v1
GAAATTAATACGACTCAC
TATAGGGAGGTTTCAAAC
TTTACTTGCTTTACATAGA
5nmol(約40ug)
EAA0065B
S-RPA-Reverse_v1
TCCTAGGTTGAAGATAA
CCCACATAATAAG
5nmol(約40ug)
EAA0065C
Orf1ab-RPA-Forward_v1
GAAATTAATACGACTCAC
TATAGGGCGAAGTTGTA
GGAGACATTATACTTAAACC
5nmol(約40ug)
EAA0065D
Orf1ab-RPA-Reverse_v1
TAGTAAGACTAGAATT
GTCTACATAAGCAGC
5nmol(約40ug)
EAA0065E
S-crRNA
GAUUUAGACUACCCCAAAAA
CGAAGGGGACUAAAACGCAGCA
CCAGCUGUCCAACCUGAAGAAG
5nmol(約40ug)
EAA0065F
Orf1ab-crRNA
GAUUUAGACUACCCCAAAAA
CGAAGGGGACUAAAACCCAACCU
CUUCUGUAAUUUUUAAACUAU
5nmol(約40ug)
EAA0065G
Lateral-Flow-Reporter-1(cas13a)
5’-/FITC/mArArUrGrGrCm
AmArArUrGrGrCmA/3DGX/-3’
10nmol(約40ug)
EAA0065H
Lateral-Flow-Reporter-2(cas13a)
5’-/FAM/mArArUrGrGrCm
AmArArUrGrGrCmA/3Bio/-3’
10nmol(約40ug)
EGY0004B
20×SYBR Green I for Real Time PCR
 
1ml
EGY0004B
20×SYBR Green I for Real Time PCR
 
5ml
EGY0004C
10000×SYBR Green I for Real Time PCR
 
1ml
EGY0004C
10000×SYBR Green I for Real Time PCR
 
5ml
11010
dsGreen for Real-Time PCR, 100×
 
100ul
41010
dsGreen for Real-Time PCR, 100×
 
1ml

RPA相關
貨號
品名
包裝規格
TABAS03KIT
TwistAmp® Basic
96 reactions
TALQBAS01
TwistAmp® Liquid Basic
100 reactions
CONTROL01EXO
TwistAmp® exo positive control oligo mix
 
CONTROL01DNAE
TwistAmp® exo positive control template
 

RNA提取&保存
貨號
品名
包裝規格
DEG0684B
病毒基因組RNA提取試劑盒(DP315-R)
50次
52201-013
RNAstable RND穩定劑液體裝
10ml
53201-013
RNAstable RND穩定劑液體裝
2ml
93221-001
RNAstable RND穩定劑管式(干式)
25管

細胞因子檢測
貨號
品名
描述
EM10001
Multiplex Human Cytokine ELISA Kit (Inflammatory)
人炎性細胞因子ELISA試劑盒
用于細胞培養上清液、血清、血漿和其它生物樣品內人炎性細胞因子( IL-1a, IL-1b, L-6, IL-8, INF-g, GM-CSF, MCAF, TNF-a)的同步定量檢測。
EM10002
Multiplex Human Cytokine ELISA Kit (M1/M2/MDSC)
人髓源性抑制細胞(MDSC)相關細胞因子ELISA試劑盒
用于細胞培養上清液、血清、血漿和其它樣品內人細胞因子(GM-CSF, IFN-γ, IL-4, IL-6, IL-10, IL-12, MCAF and TNF-α)的同步定量檢測
EM10003
Multiplex Human Cytokine ELISA Kit (Th1/Th2/Th17)
輔助性T細胞分化(Th1/Th2/Th17)相關細胞因子ELISA試劑盒
用于細胞培養上清液、血清、血漿和其它樣品內人細胞因子(IFN-γ, IL-2,IL-4, IL-10, IL-13, IL-17A, IL-22 和 TNF-α)的同步定量檢測
參考資料
[1] Cryo-EM structure of the 2019-nCoV spike in the prefusion conformation
[2] 今日《科學》:科學家揭示新冠病毒S蛋白高清結構,有望助力疫苗和診療技術開發
[3] Science發布冠狀病毒研究突破性成果:解析關鍵蛋白,有望支持疫苗設計
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