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Nature Medicine:COVID-19幸存者一年后血液基因表達(dá)變化

來(lái)源:作者:人氣:-發(fā)表時(shí)間:2022-12-28 10:30:00【
摘要:西奈山醫(yī)學(xué)院的研究人員發(fā)表了首批將COVID-19期間血液基因表達(dá)變化與SARS-CoV-2感染急性后遺癥(也稱為“長(zhǎng)COVID”)聯(lián)系起來(lái)的研究之一,這些患者在因嚴(yán)重COVID-19住院一年多后出現(xiàn)了這種變化。
西奈山的研究人員發(fā)表了首批將COVID-19期間血液基因表達(dá)變化與患者因嚴(yán)重COVID-19住院一年多后的“長(zhǎng)COVID”聯(lián)系起來(lái)的研究之一。長(zhǎng)COVID是更專業(yè)地“SARS-CoV-2感染急性后后遺癥”的簡(jiǎn)化名稱。
這項(xiàng)研究結(jié)果于12月8日發(fā)表在《Nature Medicine》雜志上,強(qiáng)調(diào)需要在感染階段給予更多關(guān)注,以更好地了解開(kāi)始然后最終導(dǎo)致長(zhǎng)COVID的過(guò)程,這可能有助于改善感染后出現(xiàn)持續(xù)癥狀的COVID-19幸存者的預(yù)防策略和治療選擇。
西奈山醫(yī)學(xué)院的研究人員發(fā)表了首批將COVID-19期間血液基因表達(dá)變化
圖1 西奈山醫(yī)學(xué)院的研究人員發(fā)表了首批將COVID-19期間血液基因表達(dá)變化(圖源:[1])
除其他發(fā)現(xiàn)外,研究小組還在免疫系統(tǒng)的抗體產(chǎn)生細(xì)胞漿細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)了兩種分子上不同的長(zhǎng)COVID癥狀亞群,它們?cè)诩毙訡OVID-19期間具有相反的基因表達(dá)模式。在后來(lái)出現(xiàn)肺部問(wèn)題的患者中,抗體產(chǎn)生基因的含量較低。然而,對(duì)于有其他癥狀的患者,如嗅覺(jué)或味覺(jué)喪失和睡眠中斷,相同的抗體產(chǎn)生基因反而更豐富。在同一細(xì)胞中觀察到的這些相反的模式,以及在其他細(xì)胞類型中觀察到的其他獨(dú)特模式,表明存在多個(gè)獨(dú)立過(guò)程,導(dǎo)致不同的COVID長(zhǎng)癥狀;這些過(guò)程在急性感染期間已經(jīng)存在。
研究流程
圖2 研究流程(圖源:[1])
“我們的研究結(jié)果表明,在COVID-19感染期間,已經(jīng)可以檢測(cè)到導(dǎo)致長(zhǎng)COVID的分子過(guò)程,”共同通訊作者Noam D. Beckmann博士說(shuō),他是西奈山伊坎醫(yī)學(xué)院查爾斯·布朗夫曼個(gè)性化醫(yī)學(xué)研究所的醫(yī)學(xué)助理教授(數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)和數(shù)字醫(yī)學(xué))和數(shù)據(jù)科學(xué)戰(zhàn)略副主任。“此外,我們看到多種分子不同的路徑開(kāi)始導(dǎo)致長(zhǎng)COVID,為長(zhǎng)期癥狀之間的差異提供了獨(dú)特的觀點(diǎn)。”
研究人員利用西奈山COVID-19生物樣本庫(kù),檢測(cè)了2020年4月至6月期間因COVID-19住院的500多名患者血液樣本的基因表達(dá)數(shù)據(jù)。其中160多名患者提供了住院六個(gè)月或更長(zhǎng)時(shí)間后仍存在癥狀的自我報(bào)告評(píng)估。研究小組測(cè)試了血液中表達(dá)的每個(gè)基因與每個(gè)長(zhǎng)COVID癥狀的相關(guān)性,考慮ICU入院情況、住院期間COVID-19的嚴(yán)重程度、性別、年齡和其他變量。然后,研究小組測(cè)試了13種不同類型的免疫細(xì)胞(包括漿細(xì)胞)的特異性關(guān)聯(lián)。最后,根據(jù)這些關(guān)聯(lián)是否與患者對(duì)病毒特異性抗體水平的變化相匹配來(lái)對(duì)其進(jìn)行分類。
PASC癥狀描述
圖3 PASC癥狀描述(圖源:[1])
“對(duì)于長(zhǎng)期的COVID癥狀,如嗅覺(jué)或味覺(jué)問(wèn)題,將漿細(xì)胞中的抗體基因表達(dá)與對(duì)抗SARS-CoV-2刺突蛋白的實(shí)際抗體水平聯(lián)系起來(lái),表明與身體對(duì)病毒的反應(yīng)有直接聯(lián)系,”查爾斯·布朗夫曼個(gè)性化醫(yī)學(xué)研究所的數(shù)據(jù)科學(xué)分析師Ryan C. Thompson博士說(shuō)。“另一方面,肺部疾病的基因表達(dá)模式與SARS-CoV-2特異性抗體水平不匹配,這凸顯了由COVID-19引發(fā)的導(dǎo)致長(zhǎng)COVID的不同免疫過(guò)程。”
該團(tuán)隊(duì)表示,長(zhǎng)COVID的定義仍然很模糊,未來(lái)的研究應(yīng)該考慮到感染的初始階段,以更全面地描述長(zhǎng)COVID的分子過(guò)程,并確定可以幫助預(yù)測(cè)、治療和預(yù)防長(zhǎng)癥狀的生物標(biāo)志物。
“我們的研究結(jié)果表明,有可能使用感染階段的數(shù)據(jù)來(lái)預(yù)測(cè)患者幾個(gè)月后可能發(fā)生的情況,”聯(lián)合通訊作者、遺傳學(xué)和基因組科學(xué)副教授、查爾斯·布朗夫曼個(gè)性化醫(yī)學(xué)研究所聯(lián)合所長(zhǎng)Alexander W. Charney說(shuō)。“我們不應(yīng)忽視長(zhǎng)COVID研究中的感染階段——這顯然是一個(gè)關(guān)鍵的時(shí)間窗口,人體對(duì)SARS-CoV-2的反應(yīng)可能會(huì)為未來(lái)的研究奠定基礎(chǔ)。”
參考資料:
[1] Molecular states during acute COVID-19 reveal distinct etiologies of long-term sequelae

 

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